Aankondiging opdrachtLeveringenEuropees
Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software
Samenvatting van het bestek
AI-samenvatting — controleer altijd de officiële stukken
Voor deze aanbesteding is (nog) geen samenvatting beschikbaar. We vatten alleen documenten samen die op TenderNed staan.
Omschrijving
Data from the sequencer is processed through a bioinformatics pipeline (currently GATK, soon transitioning to DRAGEN), which outputs all possible variants relative to the reference genome in tabular form in a VCF file. This VCF file is imported into the software, where annotation first takes place: all valid variants are separated from invalid variants based on quality parameters. Because this results in a large number of variants, they are subsequently filtered based on laboratory defined criteria, such as genomic position, population frequency, known pathogenicity based on literature or insilico prediction tools. All remaining variants must then be interpreted using various tools/databases. The software supports the use and visualisation of data from these tools, enabling fast and efficient interpretation — including through an AI tool that proposes the most likely causal variant for the disorder. software will be used by more or less 200 personel for diagnostics and research purposes. estimated value is based on 8 years
CPV-codes
- 48180000Medische software (hoofdopdracht)
Meer in deze hoofdgroep: Software en informatiesystemen
Documenten
Er staan 24 documenten op TenderNed. Downloaden kan via de officiële publicatie.
| Naam | Soort | Grootte |
|---|---|---|
| TN577692 - EF16 Aankondiging van een opdracht - algemene richtlijn, standaardregeling 20260318114358 (pdf) | Aankondiging | 221 kB |
| TN577692 - EF16 Aankondiging van een opdracht - algemene richtlijn, standaardregeling 20260319115615 (pdf) | Aankondiging | 223 kB |
| TN577692 - EF16 Aankondiging van een opdracht - algemene richtlijn, standaardregeling 20260429101237 (pdf) | Aankondiging | 223 kB |
| TN577692 - EF16 Aankondiging van een opdracht - algemene richtlijn, standaardregeling 20260513172004 (pdf) | Aankondiging | 223 kB |
| TN577692 - EF16 Aankondiging van een opdracht - algemene richtlijn, standaardregeling 20260601120236 (pdf) | Aankondiging | 227 kB |
| Annex A1 Draft Framework Agreement ICT Agreement (1) (docx) | Aanbestedingsdocument | 224 kB |
| Annex A2 General Purchase Conditions Amsterdam UMC NFU (ENG) (Versie 3) (1) (pdf) | Aanbestedingsdocument | 1,4 MB |
| Annex A3 GPC Additions Amsterdam UMC location AMC and VUMC (ENG) (Versie 6) (1) (pdf) | Aanbestedingsdocument | 236 kB |
| Annex A4 BoZ model data processing agreement 2022-version NFU (2) (docx) | Aanbestedingsdocument | 241 kB |
| Annex A5 Waiting room Aggreement (docx) | Aanbestedingsdocument | 170 kB |
Toon de overige 14 documenten
| Naam | Soort | Grootte |
|---|---|---|
| Annex A6 Clouddiensten beleidskader - Dienst ICT - Amsterdam UMC (Versie 1) (1) (pdf) | Aanbestedingsdocument | 372 kB |
| Annex B1 Form NVI (xlsx) | Aanbestedingsdocument | 696 kB |
| Annex F1 Combination statement (2) (docx) | Aanbestedingsdocument | 31 kB |
| Annex H1 Reference information form (1) (doc) | Aanbestedingsdocument | 69 kB |
| Annex H2, Confidentaility statement (doc) | Aanbestedingsdocument | 55 kB |
| Annex I9a Program of requirements ICT (1) (xlsx) | Aanbestedingsdocument | 32 kB |
| Annex I9b Program of Requirements Functional and list of wishes (7) (xlsx) | Aanbestedingsdocument | 30 kB |
| Annex I9c Use cases (3) (docx) | Aanbestedingsdocument | 49 kB |
| Annex I9d List prices (2) (xlsx) | Aanbestedingsdocument | 41 kB |
| Annex I9e in-outlist (1) (xlsx) | Aanbestedingsdocument | 21 kB |
| guideline genome variant interpretation software 2026 (docx) | Aanbestedingsdocument | 156 kB |
| uea_577692_20260317150649 (pdf) | Aanbestedingsdocument | 515 kB |
| Bijlage 2 Formulier NVI (2) (xlsx) | Nota van inlichtingen | 660 kB |
| questions and aswers 2 1 (xlsx) | Nota van inlichtingen | 680 kB |
Tijdlijn van deze aanbesteding
Publicaties van Stichting Amsterdam UMC met kenmerk RD, oudste eerst.
- Aankondiging opdracht: Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software (deze pagina)
- Rectificatie: Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software
- Rectificatie: Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software
- Rectificatie: Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software
- Vroegtijdige beëindiging: Replacing genome variant annotation, filtering and interpretation software
Meer open opdrachten
In Software en informatiesystemen
- Planning- en roosterapplicatie · Gemeente Vlissingen
- Business Process Management (BPM)-tool · Gemeente Lansingerland
- DAS Standaardprogrammatuur · SSC IUC DJI
- BPV SaaS oplossing · ROC van Amsterdam - Flevoland
- BPV SaaS oplossing · ROC van Amsterdam - Flevoland
Van Stichting Amsterdam UMC
- Raamovereenkomst Migratie regeltechniek in & aan het Amsterdam UMC v3 · sluit 15 november 2026
- Digitale Coupescanners Pathologie · sluit 23 november 2026
- EA Schoonmaak AmsterdamUMC · sluit 1 december 2026